在一个名为“黒の教室”的精英私立学校里,每年只有极少数的学生被选入这个秘密课程。这些学生被称为“影子”,目的是接受一系列复杂且艰险的训练,以成为执行特殊任务的专业人士。故事围绕着五名背景各异的学生展开:有黑客天才、前街头小混混、天才音乐家、自闭症数学天才和前特工的遗孤。他们之间互相竞争却又不得不依赖对方来生存。在经历了一系列鲜为人知的体验后,他们发现这个计划的背后竟隐藏着一个惊天的阴谋。追寻真相的过程中,这些年轻人逐渐明白了信任、友情以及自我身份的真正意义,最终他们必须联手挑战整个秘密组织,以谋求自由与正义。